慢性扁桃体炎可以有多种并发症，如炎症向邻近器官蔓延感染侵入扁桃体周围间隙及附近器官则可并发下列局部并发症，如扁桃体周围炎及脓肿、中耳炎、鼻窦炎、咽后壁脓肿、喉炎、颈部淋巴结炎。全身并发症偶可引起败血症或远处器官感染。或引起风湿热、风湿性心脏病、关节炎、肾炎等疾病。要防止并发症的发生必须积极治疗原发病。
慢性扁桃体炎多由急性扁桃体炎反复发作或因扁桃体隐窝引流不畅，窝内细菌、病毒滋生感染而演变来。这些积存的细菌不断分泌毒素，并经过腺窝周围的血管网传播到全身。因而扁桃体成为不少全身性疾病如风湿热、肾炎等的病灶，这也正是其危害所在。
健康人扁桃体所带菌种与季节有关：乙型溶链带菌率冬季大于夏季，冬季以流感杆菌为多，夏季以副流感杆菌为多。
扁桃体炎是由于细菌及分泌物积存于扁桃体窝导致的。而这些积存的细菌不断分泌毒素，并经过腺窝周围的血管网传播到全身。一般治疗增强体质和免疫力，急性扁桃体炎要充分治疗。在临床上用慢严舒柠颗粒治疗扁桃体炎效果不错，在加上消炎药，比如；阿莫西林等。
平时多喝板蓝根水，能起到预防作用。早晚用淡盐水漱口，以能感到微咸为宜。也有专门针对慢性扁桃体炎的漱口液，对预防慢性扁桃体炎的反复发作特别好。对于扁桃体反复发炎的，最好的治疗方法就是做扁桃体切除手术。
生活中可以通过以下方式预防：
(1)、注意休息，多饮水，通大便，进流食或软食。
(2)、咽痛明显时要注意尽早输液治疗。以免感染扩散。
(3)、反复发作时或伴有相应症状时可以在急性发作时进行心电图及小便或抗氧的检查，以排除并发肾炎，心肌炎，关节炎等的可能。
(4)、反复发作或伴有扁桃体周围脓肿、周围炎的病人最好在炎症消退后手术治疗。
(5)、要注意与会厌炎相区别。
引起孩子扁桃体炎的原因引起孩子扁桃体炎的原因，一个是可能和孩子抵抗力有关，小孩子本身在发育阶段，比较容易受到外界细菌或病毒感染引起扁桃体炎，一般症状表现有咽部不适、有异物感或喉咙干痒，刺激性咳嗽口臭等，在出现这些症状时，可以选择一些中成药及时治疗缓解症状，避免病情恶化，引起支气管炎或肺炎。
金银花原液是孩子扁桃体炎不错的选择，是纯金银花原液，有明确儿童用量用法，有不错的抗菌消炎，抗病毒作用，对孩子扁桃体炎的预防，早期治疗都适合，口感也很好，孩子爱喝，妈妈喂药不遭罪，除此平时要加强锻炼，增强体质，也要搞好室内外卫生，保持室内空气流通，减少空气中尘埃和化学物质的污染。